Zuletzt erfolgt die Skalierung des Gleichungssystems durch
Multiplikation der Systemmatrix und des Rechte-Seite-Vektors mit der
Diagonalmatrix 
zur Zeilenskalierung von links und
durch Multiplikation der Systemmatrix mit der Diagonalmatrix
zur Spaltenskalierung von rechts. Um die Äquivalenz
des Gleichungssystems zu erhalten, muß der Inkrementvektor wieder mit
der inversen Diagonalmatrix 
multipliziert
werden. Das lineare Gleichungssystem lautet nun
mit
Zweck der Skalierung des Gleichungssystems ist es, die Einträge der Systemmatrix in ihrer Größenordnung anzugleichen und die Diagonaldominanz zu verstärken. In MINIMOS-NT ist zusätzlich ein iterativer Algorithmus implementiert der eine automatische Skalierung des Gleichungssystems nach mathematischen Kriterien durchgeführt [13].